高通量測序又稱“新一代測序”(NGS),可以一次對幾十萬到上百萬條DNA分子進行序列測定,使得對某一物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能,目前已被科學界廣泛用來解決生物學問題。如在基因組水平上對還沒有參考序列的物種進行從頭測序(de novo sequencing),獲得該物種的參考序列,為后續(xù)研究和分子育種奠定基礎;對有參考序列的物種,進行全基因組重測序(resequencing),在全基因組水平上掃描并檢測突變位點,發(fā)現(xiàn)個體差異的分子基礎。在轉(zhuǎn)錄組水平上進行全轉(zhuǎn)錄組測序(whole transcriptome resequencing),從而開展可變剪接、編碼序列單核苷酸多態(tài)性(cSNP)等研究;或者進行小分子RNA測序(small RNA sequencing),通過分離特定大小的RNA分子進行測序,從而發(fā)現(xiàn)新的microRNA。
境象生物 (AcebioX) 利用高通量測序技術,檢測DNA、mRNA、miRNA等目標的動態(tài)變化,并結(jié)合基因組學、生物信息學、疾病生物學等專業(yè)知識,為您 提供從樣本處理到生物信息學分析的一站式服務。
境象生物 (AcebioX) 經(jīng)過多年技術積累和創(chuàng)新,建立了高效可靠的高通量測序流程,在轉(zhuǎn)錄組(mRNA, lncRNA, circRNA)測序,Small RNA測序,靶向高通量測序三個方面提供極高性價比的服務。
| 轉(zhuǎn)錄組,Small RNA測序 | 靶向高通量測序 | |
| 標準分析 | 參考基因組注釋信息整理,比對到參考基因組及結(jié)果評估,基因表達水平分析及統(tǒng)計,表達差異基因分析,表達差異基因 GO/ KEGG 富集分析,轉(zhuǎn)錄因子注釋,SNP/InDel注釋分析 | 數(shù)據(jù)質(zhì)控,統(tǒng)計測序深度及覆蓋度,與參考基因組比對,SNP/InDel分析,在各基因功能元件上的統(tǒng)計 |
| 高級分析 | 結(jié)合客戶的材料與需求,協(xié)商個性化信息分析內(nèi)容 | |
測序服務周期為15-25個工作日,生物信息分析服務周期為10個工作日,服務流程如下:
適用樣本類型包括核酸,組織、細胞樣本,石蠟包埋樣本、活檢穿刺樣本、血液、血漿、肺泡液等。
建議干冰運輸。其中,基因組DNA樣本,建議用TE溶解;總量≥50ng;OD260/ 280=1.8-2.0;濃度≥10ng/ μL。
RNA樣本,建議總RNA總量≥1 ng;OD260 /280=1.8-2.0;濃度≥1 ng /μL。